基因的上下游分析

基因的上下游分析是做生物医学研究必要的分析之一，但需要整合各种调控数据库以及多样本基因表达数据，某些研究人员可能无从下手！ 您只需要提供感兴趣的基因（或者miRNA，TF）

疾病生存率分析

基因与疾病的生存率分析是常见的疾病预后分析之一，生存率分析需要大量的临床样本和临床数据，某些科研工作者可能束手无策！ 云生信团队整合了世界权威公共数据库所有临床样本

Pathway crosstalk

细胞内存在众多的pathway，绝大多数pathway 之间都会通过pathway 分支相互连接，从而形成复杂的pathway 网络。相互连接的pathway 中，一条pathway的蛋白节点可以通过蛋白相互作用去影响其他

DCGL差异共表达分析

目前，对基因的表达数据分析方法众多，常规的如差异表达基因对比、聚类等，但越来越多的研究认为只是寻找在不同条件下表达量有显著差异的基因并不能准确地反映出基因间的共同

WGCNA分析

基因共表达网络分析致力于寻找协同表达的基因模块，并探索基因网络与研究者关注的表型之间的关联关系。它基于高通量的微阵列技术，应用基因表达芯片得到实验数据没从转录水平

miRNA靶基因分析

miRNA是一类广泛存在于真核生物中的非编码RNA，成熟的miRNA的长度在22nt左右，在转录后水平上通过调节其靶基因行使功能。miRNA已经被证明与多种癌症相关基因的表达有关。因此，识别

转录调网络控分析

转录因子（Transcriptionfactors，TFs）可以结合在基因上游特异的核苷酸序列上，以此调控基因的表达。基因转录调控网络描述转录因子及其调控的基因之间的关系。理论上，基因调控网络

时间序列分析

时间序列分析 STEM软件 (Short Time-series Expression Miner) R包 Mfuzz 1.背景介绍 通过在不同时间点对细胞周期以及特地状态条件下的基因表达进行测定，获得的基因表达数据，即时间序列基因表

基于NetBox的蛋白质互作网络构建

NetBox是基于Java的开发的一款软件工具，可用于执行人类蛋白互作网络的分析。该工具基于人类互作网络（human interaction network，HIN），该网络由四个数据源组成，HPRD， Reactome, NCI-Nature

疾病甲基化和基因表达谱数据分析

DNA甲基化（DNA methylation）是最早发现的修饰途径之一，大量研究表明，DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。Cox比例风

基因富集结果模块聚类和筛选关键基因

对基因集进行富集分析时，常会得到很多富集条目，过多的富集结果不容易展示和解释。基于FGNet包，我们开发此模块，旨在将基因注释到相似功能条目上（如GO，kegg），对功能条目进行